Den langsomme modning I produksjon av Cognac er samspillet mellom mennesket og naturen en viktig faktor. Dette kommer fram blant annet ved lagringen. Eik til lagring kommer fra Limoges eller Tronçais. Eiketreet må være minst 90 år, ideelt mellom 120 og 150 år før det hugges. Bare de nedre delene av treet brukes. Treet blir kuttet og splittet til staver. Disse tørkes i åpen luft i flere år. I bøkkeriet brukes åpen flamme ved formingen av tønnene. Typen tre, lengden av tørkingen og bruken av åpen flamme er alle faktorer som påvirker smaken på Cognacen. Det er ingen regler som gjelder lagring av Cognac, noe som er ett unntak for en ellers over-regulert industri. Ett "chais", eller lagerhus, er i bunn og grunn bare en bygning der Cognacprodusenten oppbevarer eikefatene for modning av Cognacen. Her kommer naturen inn i bildet igjen da lagerets plassering er viktig på grunn av behovet for luftfuktighet som påvirker aldringen av Cognac. Gamle "chais" er lave bygninger, mens det finnes også høye, moderne bygniger reist i metall. Substanser som Cognacen trekker ut fra treet, forandrer dens fysiske karakter ved å gi den